Roca logrará la paz con Chile y la solución casi definitiva de todos los diferendos de límites con ese país mediante la firma del tratado de 1902 . El crecimiento económico continuó, se normalizaron los pagos de la deuda pública, y se emprendieron obras públicas de importancia. Durante sus presidencias continuó el desarrollo de la telegrafía argentina . En 1905 se finalizó el enlace telegráfico que unía Cabo Vírgenes en el Estrecho de Magallanes con la red nacional, que para entonces contaba con 50.000 km de recorrido, que en relación a una población de 8 millones la convertía en una de las más importantes del mundo.

Asumió la presidencia de la Argentina en 1895 ante la renuncia de Luis Sáenz Peña , de quien era vicepresidente. Su obra de Gobierno fue: Reforma de la Constitución Nacional . Organización de los Ministerios del Poder Ejecutivo. Creación de la Lotería Nacional de Beneficencia . Creación del Museo Nacional de Bellas Artes . Creación de la Escuela Industrial de la Nación . Verificación de la primera conscripción de ciudadanos en Curu-Malal a raíz de la amenaza de conflicto bélico con Chile por las cuestiones limítrofes. Se inaugura el edificio de la Facultad de Medicina.  

Presidente de Argentina , perteneciente al Partido Autonomista Nacional (PAN), partido que gobernó sin interrumpciones entre 1880 y 1916 . Asumió su mandato de seis años en 1892 , pero debió renunciar en 1895, acusado por la falta de legitimidad de su gobierno. Su hijo, Roque , ocuparía la presidencia entre 1910 y 1914 .

Sacó al país de una grave crisis, fundamentalmente económica, al sanear las finanzas y fundar el Banco de la Nación Argentina. Una de las primeras medidas que tomo en su gobierno fue mandar a un grupo de banqueros, estancieros y comerciantes suscriban un empréstito de 15 millones de pesos para pagar los vencimientos externos. Se construyó el Museo Histórico Nacional y la Escuela Superior de Comercio Carlos Pellegrini , se empezaron las obras para los jardines zoológico y botánico de Buenos Aires. Se rescataron tierras en poder de empresas de ferrocarriles, que los concesionarios no habían llegado a realizar los pagos. Seguido a esto, Pellegrini aplico medidas de austeridad y de ajuste, como la suspensión de obras públicas como la Casa de Gobierno, el Congreso, el edificio de correos.

Juárez Celman promovió la obra pública, en especial en Buenos Aires, con la intención de asemejarla a las capitales europeas que tomaba como referencia. Ordenó la construcción de edificios de gobierno, del Teatro Colón , d e numerosas escuelas y de infraestructura sanitaria y la reforma del puerto de Buenos Aires de acuerdo al proyecto de Eduardo Madero ; a la vez, impulsó la privatización de la red ferroviaria , juzgando inconveniente que un servicio tal quedara en manos del Estado.  El estímulo a la inmigración fue también importante, incluyendo la gratuidad de los pasajes y la entrega de tierras a los colonos, muchas de ellas arrebatadas a los nativos en la Campaña del Desierto de su antecesor Roca. Se impulsó también una gran reforma jurídica, incluyendo la organización procesal de los Tribunales, el establecimiento de un Registro de la Propiedad, la sanción de la Ley de Matrimonio Civil y de códigos de Minería, Penal y de Comercio.

Su gobierno llevó una gran prosperidad a la nación, alimentada por una masiva inmigración europea, la construcción de ferrocarriles y el desarrollo de las exportaciones agrícolas, y sentó las bases del moderno Estado argentino. Separó efectivamente la Iglesia del Estado, sancionando la ley de Registro Civil , lo que llevó a romper relaciones diplomáticas con el Vaticano . Dio un extraordinario impulso a la educación mediante la Ley 1420 (iniciativa de Domingo Faustino Sarmiento , entonces director del Consejo Nacional de Educación) que establecía la enseñanza primaria gratuita, obligatoria y laica para todos los habitantes del país. También sancionó la ley de los Bancos Garantidos permitiendo a las provincias emitir su propio dinero y unificó a la Argentina mediante la ley de Moneda Nacional.

Resolvió la crisis de 1874 y 1875 mediante el ajuste del gasto público, incluyendo el despido de funcionarios y la reducción de salarios. Más tarde se inició la exportación de carne argentina en los primeros buques refrigerados.Si bien inicialmente apoya los planes de Adolfo Alsina para contener el avance de los aborígenes, en 1876 impulsó la Conquista del desierto , plan del ministro de Guerra, General Julio Argentino Roca , quien se hizo cargo de la situación de manera sangrienta y violenta. Millones de hectáreas liberadas pudieron ser utilizadas ahora por los estancieros argentinos. En 1880 , tras resolver un nuevo levantamiento de Carlos Tejedor, el Congreso aprobó, a instancias suyas, la federalización de la Ciudad de Buenos Aires .